Protein–RNA interactions for Protein: Q3V172

Sel1l2, Protein sel-1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sel1l2Q3V172 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sel1l2Q3V172 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms