Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc185Q3V118 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc185Q3V118 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms