Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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SvipQ3UZP4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SvipQ3UZP4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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