Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnpc3Q3UZ01 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnpc3Q3UZ01 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms