Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
D130052B06RikQ3UW13 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms