Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnga4Q3UW12 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms