Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Skap1Q3UUV5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Skap1Q3UUV5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms