Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
B230104I21RikQ3USW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B230104I21RikQ3USW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms