Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TceancQ3US16 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TceancQ3US16 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms