Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS2

Zscan4f, Zinc finger and SCAN domain containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4fQ3URS2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zscan4fQ3URS2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms