Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp560Q3URI6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms