Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rmi2Q3UPE3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms