Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdgfl2Q3UMU9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms