Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsg1Q3UM18 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsg1Q3UM18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms