Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc33Q3ULW6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc33Q3ULW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms