Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ceacam5Q3UKK2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms