Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rmdn3Q3UJU9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms