Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp19Q3UJD6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms