Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LchnQ3UHG7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LchnQ3UHG7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms