Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Wdr41Q3UDP0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms