Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atxn7l3bQ3UD01 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms