Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ssbp4Q3U4B1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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