Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kdm4dQ3U2K5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdm4dQ3U2K5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms