Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pag1Q3U1F9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pag1Q3U1F9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms