Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc9Q3U0M1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc9Q3U0M1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms