Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hace1Q3U0D9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hace1Q3U0D9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms