Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrrc28Q3TX51 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms