Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srsf6Q3TWW8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms