Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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