Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc136Q3TVA9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc136Q3TVA9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms