Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shcbp1lQ3TTP0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shcbp1lQ3TTP0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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