Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gdpd4Q3TT99 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms