Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSG4

Alkbh5, RNA demethylase ALKBH5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh5Q3TSG4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Alkbh5Q3TSG4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alkbh5Q3TSG4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms