Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fndc4Q3TR08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms