Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctdnep1Q3TP92 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms