Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc10Q3TLI0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms