Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RubcnlQ3TD16 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RubcnlQ3TD16 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms