Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Prr27Q3SYJ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Prr27Q3SYJ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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