Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ccbe1Q3MI99 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms