Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Treml4Q3LRV9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Treml4Q3LRV9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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