Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Riiad1Q3KNY5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Riiad1Q3KNY5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms