Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp8Q2V6D6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp8Q2V6D6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms