Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Myo3bQ1EG27 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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