Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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ptchd1Q14B62 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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