Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Rpusd2Q149F1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd2Q149F1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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