Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc162pQ0VG85 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc162pQ0VG85 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms