Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Samd12Q0VE29 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms