Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
StumQ0VBF8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms