Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itgb8Q0VBD0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Itgb8Q0VBD0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Itgb8Q0VBD0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Itgb8Q0VBD0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Itgb8Q0VBD0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Itgb8Q0VBD0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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