Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps8Q0P5W1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps8Q0P5W1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms